Wissenschaftlerin / Wissenschaftler für den Bereich Bioinformatik (w/m/d)

Wissenschaftlerin / Wissenschaftler für den Bereich Bioinformatik (w/m/d)

Kulmbach

Kennziffer: 037/2026

Aufgabe

Entwicklung, Implementierung, und Wartung von Anwendungen und Pipelines für die automatisierte Auswertung von Daten aus biochemischen Untersuchungsmethoden Auswertung von Daten aus der DNA-sequenzbasierten Analytik (Metabarcoding, Metagenomics) sowie aus der Massenspektrometrie (Metabolomik, Proteomik)

Qualifikation

Das bringen Sie mit: Ein erfolgreich abgeschlossenes Master-Studium im Bereich Informatik, Bioinformatik, Data Science, Molekularbiologie, Biochemie, Lebensmittelchemie oder eine vergleichbare Qualifikation Praxis-Erfahrung im Aufbau von Analyse-Pipelines für NGS, Proteomik oder Metabolomik Sicherer Umgang mit relevanten Datenbanken (z. B. NCBI, BOLD, Mascot, PRIDE, ProteomeXchange, METLIN, MassBank) Fundierte Kenntnisse in gängigen Programmiersprachen (Python, Perl, R, C/C++, ) Routiniert im Arbeiten mit Linux, der Kommandozeile sowie HPC- bzw. Server-Umgebungen Mindestens gute Kenntnisse der englischen Sprache in Wort und Schrift Sehr gute Ausdrucksfähigkeit in deutscher Sprache in Wort und Schrift Wünschenswert sind: Erfahrung mit der bioinformatischen Auswertung von Sequencing-by-Synthesis (Illumina) oder Long-Read-Sequencing (Oxford Nanopore) Daten, inklusive Tools wie DADA2, QIIME 2, BLAST und taxonomischer Zuordnung Sicherer Umgang mit Container-Technologien (z. B. Docker, Podman) Erfahrung in der Arbeit mit Referenzdatenbanken Nachgewiesene Mitarbeit an wissenschaftlichen Publikationen Praktische Kenntnisse in relationalen Datenbanksystemen, vorzugsweise PostgreSQL Erfahrung im Umgang mit Versionsverwaltungssystemen, insbesondere Git Sicherer Umgang mit KI-gestützten Programmierwerkzeugen (z. B. Agentic Coding) Wir freuen uns auf eine engagierte Person, die sich durch eine hohe Motivation, Team- und Kooperationsfähigkeit sowie eine selbstständige und verantwortungsbewusste Arbeitsweise und die Fähigkeit zur inter- und intradisziplinären Zusammenarbeit auszeichnet.

Die vollständige Anzeige finden Sie beim Klick auf den Onlinebewerbungs-Button oder unter folgendem Link:

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